Index

_

__version__ (in module labtools)

B

bc_dict (labtools.adtools.sort.Sort attribute)

bin_counts (labtools.adtools.sort.Sort attribute) bin_values (labtools.adtools.sort.Sort attribute)

C

calculate_activity() (in module labtools.adtools.counter)

convert_bcs_from_map() (in module labtools.adtools.counter) create_map() (in module labtools.adtools.counter)

D

data_files (labtools.adtools.sort.Sort attribute)

design_file (labtools.adtools.sort.Sort attribute) downsample() (labtools.adtools.sort.Sort method)

G

get_numreads() (in module labtools.adtools.seqlib)

get_numreads_old() (in module labtools.adtools.seqlib)

L

labtools module labtools.adtools module labtools.adtools.counter module labtools.adtools.finder module

labtools.adtools.seqlib module labtools.adtools.sort module labtools.predictors module labtools.shuffle module

M

main() (in module labtools.adtools.counter) module labtools labtools.adtools labtools.adtools.counter labtools.adtools.finder labtools.adtools.seqlib labtools.adtools.sort labtools.predictors labtools.shuffle

P

process() (labtools.adtools.sort.Sort method)

pull_AD() (in module labtools.adtools.finder) pull_barcode() (in module labtools.adtools.finder)

R

read_bc_dict() (in module labtools.adtools.seqlib) read_fasta() (in module labtools.adtools.seqlib)

read_fastq() (in module labtools.adtools.seqlib) read_fastq_big() (in module labtools.adtools.seqlib)

S

seq_counter() (in module labtools.adtools.counter)

Sort (class in labtools.adtools.sort) sort_normalizer() (in module labtools.adtools.counter)

W

windowed_shuffle() (in module labtools.shuffle)

write_bc_dict() (in module labtools.adtools.seqlib)